Štruktúra valenčného elektrónového obalu atómu Be je 2s2, jeho atómový polomer je 89 pm, iónový polomer Be2+ je 31 pm a elektronegativita Be je 1,57. Kvôli obzvlášť malému atómovému a iónovému polomeru berýlia a relatívne vysokej elektronegativite je tendencia berýlia tvoriť kovalentné väzby významnejšia, na rozdiel od iných prvkov v tej istej skupine, ktoré tvoria hlavne iónové zlúčeniny. Preto berýlium často vykazuje anomálne vlastnosti, ktoré sa líšia od iných prvkov tej istej rodiny.
(1) Berýlium ľahko vytvára na povrchu hustý ochranný film a neinteraguje s vodou, zatiaľ čo iné kovy rovnakej skupiny horčík, vápnik, stroncium a bárium ľahko reagujú s vodou.
(2) Hydroxid berýlia je amfotérny, zatiaľ čo hydroxidy iných prvkov tej istej skupiny sú stredne silne alkalické alebo silne alkalické.
(3) Soli berýlia sú silne hydrolyzované za vzniku tetraedrických iónov [Be(H2O)4]2+ a väzba Be-O je veľmi silná, čo oslabuje väzbu OH, takže hydratované ióny berýlia majú tendenciu k stratiť protóny:
Preto sú soli berýlia v čistej vode kyslé. Soli iných prvkov tej istej skupiny (okrem horčíka) nemajú žiadnu hydrolýzu.